Структура системы – модульная, каждый модуль — отдельная программа, которая может работать как автономно, так и в едином комплексе.
Любое производство представляет собой информационную цепочку (от проектирования до получения готовой продукции и продажи), звеньями которой являются различные подразделения. Каждый модуль системы БАЗИС автоматизирует труд одного или нескольких смежных подразделений и является специализированным. Однако наличие связи между модулями и единый формат данных позволяет работать с ними как с единым продуктом. Внедрение модульной системы можно проводить поэтапно, начиная с отдельных подразделений, тем самым разумно распределяя усилия и средства.